Tổ chức khủng bố Waganbu bí mật xâm nhập Hong Kong, âm mưu chiếm đoạt vũ khí hóa học và gây ra hàng loạt nguy cơ an ninh nghiêm trọng. Phạm Thiếu Phong, chỉ huy đội Phi Hổ, được lệnh truy quét nhóm khủng bố nhưng nhanh chóng rơi vào thế bị động trước những cuộc tấn công tàn nhẫn. Trước tình hình cấp bách, Triển Bác Văn, tân tổng chỉ huy đội Phi Hổ, tập hợp các cảnh sát tinh nhuệ như Trương Vĩ Hoa, Trương Gia Hiên và Cao Tử Lạc để thành lập đội phản khủng bố bí mật S Team. Với sự hỗ trợ của Hứa Tuấn Phi từ Interpol, các thành viên phải gạt bỏ ân oán cá nhân, phối hợp điều tra mạng lưới tội phạm quốc tế và ngăn chặn thảm họa vũ khí hóa học trước khi Hong Kong rơi vào khủng hoảng.